Soutenance thèse Justine Garraud : “Réduction de la charge en cuivre des sols viticoles par phytoextraction associée à la bioaugmentation” – 9h à l’amphithéâtre LPG – Faculté des Sciences à Nantes

L’utilisation répétée de fongicides à base de cuivre (Cu) a engendré son accumulation dans les sols viticoles. La phytoextraction permet de réduire leur charge en Cu. Dans la solution du sol, le Cu est cependant complexé majoritairement à la matière organique dissoute (MOD), qui est peu phytodisponible. Les travaux menés ont visé à (i) sélectionner une plante accumulatrice de Cu qui puisse être valorisée en alimentation animale et (ii) augmenter le pool de Cu phytodisponible par bioaugmentation du sol. Parmi 7 plantes testées en hydroponie (avoine, chanvre, chicorée, moutarde brune, ray-grass, sarrasin et tournesol), la chicorée a accumulé le plus de Cu dans ses parties récoltables. Un isolat et un consortium bactérien ont été testés pour i) mobiliser le Cu des phases porteuses du sol, ii) dégrader les complexes Cu-MOD et iii) accroître la croissance de la plante.L’isolat Pseudomonas sp. 171 (P171) a été utilisé pour ses propriétés PGPR (plant growth promoting rhizobacteria) et de mobilisation du Cu. En revanche, aucune bactérie capable de dégrader la MOD n’a été clairement identifiée. Afin d’améliorer la survie de P171, de potentiels partenaires ont été identifiés sur la base de réseaux d’association. Un consortium constitué de Flavobacterium (isolat F47-2) et de P171 a été testé en cultivant la chicorée sur le sol viticole bioaugmenté par ce consortium (sous forme libre ou immobilisé dans des billes d’alginate). La chicorée a accumulé plus de cuivre avec le consortium qu’avec P171 seul. Le suivi de P171 par le gène GFP et par métabarcoding du gène rpoB et 16S a également montré que l’immobilisation de ce consortium favorisait l’installation de P171 dans le sol.